Programme : 9h-9h15 : Joséphine Martin, Méthodes à noyau pour l’analyse exploratoire de graphes Encadrants : Nathalie Vialaneix et Marie-Laure Martin (IPS2)
9h15-9h30 : Alexis Mergez, Deep learning for genome assembly error correction Encadrants : Raphaël Mourad et Matthias Zytnicki
9h30-9h45 : Aurélien Thiriet (CIRAD de Montpellier), Comparaison d’approximations pour l’estimation dans des modèles mixtes généralisés pour données catégorielles [distanciel] Encadrants : Nathalie Peyrard, Sandra Plancade et Jean-Baptiste Durand (CIRAD)
9h45-10h : Hajar Bouamout, Alignement de lectures sur les pangénomes Encadrants : Benjamin Linard et Matthias Zytnicki
10h-10h15 : Hassan Houmed, Deep learning for sRNA classification Encadrants : Raphaël Mourad et Christine Gaspin
10h15-10h30 : Nina Marthe (Montpellier), Transfert d’annotations dans des graphes de pangénome [distanciel] Encadrants : François Sabot (IRD Diade) et Matthias Zytnicki
10h30-10h45 : pause
10h45-11h : Gwendaëlle Cardenas, Analyse différentielle de données Hi-C avec le package treediff Encadrants : Nathalie Vialaneix et Sylvain Foissac (GenPhySE)
11h-11h15 : Prasanna Maddila, Apprentissage par renforcement pour le calcul d’équilibres de Nash dans les jeux stochastiques. Application au calcul/recalcul d’objectifs de haut niveau dans les jeux de conservation stochastiques Encadrants : Meritxell Vinyals et Régis Sabbadin
11h15-11h30 : Annabelle Bru, Comparaison d’outils pour l’analyse de modifications d’ARN non codant à partir de données nanonopre «ARN direct » Encadrants : Nathalie Vialaneix et Christine Gaspin
11h30-11h45 : Siegfried Dubois (Rennes), Graphes de variations pangénomiques : structures et outils [distanciel] Encadrants : Claire Lemaitre (Inria Genscale), Thomas Faraut (GenPhySE) et Matthias Zytnicki
11h45-12h : Alexandre Monteil, Boîte à outils pour le contrôle de la structure des fichiers tabulaires Encadrant : Patrick Chabrier
12h-12h15 : Hoang Giang Pham, Conception d’un pipeline bioinformatique d’analyse de données de petits ARN Encadrant : Matthias Zytnicki