BioInformatique des ARN
PROGRAMME DES JOURNÉES ARENA
20-21-22 FEVRIER 2012
Lundi 20 février
14h00-14h30 --- Introduction aux journées
14h30-15h40 --- Laederach A.
Le changement de conformation de l'ARN induit par mutation: un mécanisme généralisé de la maladie ?
15h40-16h20 --- Guérin C., BaSysBio Consortium
Identification of Bacillus subtilis RNA genes using Tiling Arrays
16h20-16h50 --- Pause
16h50-17h30 --- Phok K., Moisan A., Rinaldi D., Brucato N., Carpousis AJ., Gaspin C. & Clouet-d'Orval B
Identification of CRISPR and riboswitch related RNAs among novel non-coding RNAs of the euryarchaeon Pyrococcus abyssi
17h30-18h10 --- Ghozlane A., Dubois J., Dutour I., Bourqui R., Breton M. & Thébault P.
iRNA: Integrative pipeline for genome-wide detection of sRNA targets
18h10-18h50 --- Ott A., Idali A., Gautheret D.
Nouvelles méthodes de génomique comparative pour la prédiction des ARN non-codants et de leurs cibles chez les procaryotes
Mardi 21 février
8h30-9h40 --- Namy O.
Identification et caractérisation des structures secondaires de l'ARNm qui modifient le fonctionnement du ribosome.
9h40-10h20 --- Rinaudo P.
Approche à complexité paramétrée pour la prédiction de structures d'ARN
10h20-10h40 --- Pause
10h40-11h20 --- Lehmann J.
Sur l'interaction des ARN de transfert avec leurs ARN cible
11h20-12h00 --- Descrimes M., Wery M., D'Aubenton-Carafa Y., Thermes C., Morillon A., Gautheret D.
Mise au point d'un algorithme de segmentation pour la reconstruction des transcrits de levure à partir de données NGS
12h00-12h40 --- Simoes M. & Leclerc F.
Une approche par fragments pour décomposer/recomposer des ligands
12h40-14h20 --- Repas
14h30-15h10 --- Carocha V., Mendes N.D., Amaral A.J., Oliveira J., Graça C., Pinto J., Neves L., Araújo C., Grima-Pettenati J., Freitas A.T., Paiva J.
Identification and expression of novel of miRNA in E. globulus xylem tissues
15h10-15h50 --- Tempel S. & Tahi F.
MiRNAFold : Une méthode ab-initio rapide pour prédire les précurseurs miARNs dans un génome
15h50-16h30 --- Chen C.J., Servant N., Ciaudo C., Toedling J., Sarazin A., Marchais A., Duvernois-Berthet E., Cognat V., Colot V., Voinnet O., Heard E. & Barillot E.
ncRNA detection in small RNA-seq: the ncPRO-seq pipeline and profiling analysis
16h30-17h00 --- Pause
17h00-17h40 --- Juanchich A., Gaspin C., Bardou P., Mariette J., Guiguen Y., Bobe J.
MicroARNs chez la truite arc-en-ciel (Oncorhynchus mykiss) : répertoire tissulaire et implication dans l’ovogenèse
17h40-18h20 --- Castric V., Meheust R., Soucaze M., Billiard S., Gallina S., Figeac M. & Vekemans X
A complex dominance/recessivity network controlled by the repertoire of small RNAs produced by the self-incompatibility locus in Arabidopsis.
18h20-19h00 --- Wucher V., Legeai F., Nicolas J. & Tagu D.
Modélisation d'un réseau de régulation d'ARN par des microARN pour prédire des fonctions de gènes impliqués dans le mode de reproduction du puceron du pois.
Mercredi 22 février
9h00-9h40 Saffarian A., Giraud M. & Touzet H.
RNA multi-structures
9h40-10h20 Lamiable A.
Méthodes de Théorie des Jeux pour la prédiction de la structure 3D de l'ARN à gros grain.
10h20-11h00 Bussotti G., Derrien T., Erb I., Esteve-Codina A., Wilm A., Perrez-Encisco M., Notredame C.
Chercher, Aligner et Analyzer les Longs ARN Non-Codants
11h00-11h20 Pause
11h20-12h00 Cros M.-J., de Monte A., Mariette J., Bardou P., Grenier-Boley B., Gautheret D., Touzet H. & Gaspin C.
RNAspace.org: An integrated environment for the prediction, annotation, and analysis of ncRNA
12h00-12h40 Jossinet F. & Westhof E.
PyRNA: une librairie python facilitant la prédiction et l'analyse bioinformatiques des ARN non-codants
12h40-13h00 Bilan des journées
12h30-13h30 Repas, fin des journées